巴里坤县人民医院建于1942年，初称为卫生所，1953年民族区域自治后，称为巴里坤哈萨克自治县患者卫生院，1958年8月卫生院扩建后，改称为巴里坤哈萨克自治县人民医院至今（简称巴里坤县人民医院）。现位于巴里坤县城镇汉城西街健康路36号，占地总面积35452㎡，建筑面积15000㎡，业务用房12350㎡。

巴里坤县人民医院经过几代人的辛勤努力，发展至今已成为一所集医疗、急救、预防保健、康复理疗、口腔病防治为一体的综合性、的自治县医疗服务中心，担负着县域内10余万人口的医疗服务、保健和康复；承担着自治县社会医疗保险和农村新型合作医疗任务及城乡特困居民的医疗救助；并承担着县域各乡镇卫生院专业技术人员的业务培训和指导，同时承担着新疆医科大学县级非隶属实习基地和地区医学生的实习任务。医院目前事业编制126名，现有在编人员111人，其中卫生技术人员97人（医疗36人，医技27人、护士34人），财务8人，总务6人，卫生技术人员中取得高级职称资格的37人，其中取得正高资格11人，副高资格22人）；取得中级职称资格54人；初级以下10人。

医院现有编制床位100张、实际开放床位100张，(不包含急诊留观床3张、ICU室2张)。临床科室设置有内儿科、外科、妇产科、感染性疾病科、门急诊科（兼120急救中心）、口腔科、眼科、五官科、中医科（含针灸、推拿、理疗、康复）、手术室、重症监护室（ICU）。医技科室设置有检验科、放射科、功能科（含B超室、心电图室、病理室、胃镜室）、药剂科、供应室、配送中心。职能科室设置有院办公室、医务科、护理部、院感办、财务科、总务科、器械科。

巴里坤县人民医院作为县域内中心医院，临床学科种类较为齐全，在各种常见病、多发病、疑难重症病抢救治疗方面积累了临床实践经验，近年，在河南援疆医师和南京军区359医院援疆医师的支持和指导下成功完成了食道癌、肺大泡切除、甲状腺肿瘤切除、人工髋关节股骨头置换等手术。